Das Deutsche Patent- und Markenamt ist organisatorisch dem Bundesministerium der Justiz und für Verbraucherschutz (BMJV) nachgeordnet und gliedert sich in vier Hauptabteilungen: die Hauptabteilung Patente und Gebrauchsmuster, die Hauptabteilung Information, die Hauptabteilung Marken und Designs und die Hauptabteilung Verwaltung und Recht.